財政部北區國稅局表示，營利事業經查獲取得非實際交易對象開立之憑證申報扣抵銷項稅額，除核定補徵其不得扣抵之稅款外，並應依加值型及非加值型營業稅法（以下簡稱營業稅法）第51條第1項第5款及稅捐稽徵法第44條規定，擇一從重處罰。如營利事業確有進貨事實，取得非實際交易對象開立之憑證係由實際銷貨之營利事業所交付，且實際銷貨之營利事業已依法補稅處罰者，該進貨之營利事業免按前開規定處罰。

該局說明，營利事業於購買貨物或勞務時，應確實取具實際交易對象所開立之統一發票，其未依規定取得憑證及申報扣抵銷項稅額，即該當稅捐稽徵法第44條第1項「應自他人取得憑證而未取得」之客觀構成要件，一旦違反作為義務，不論依營業稅法第51條第1項第5款規定計算有無漏稅結果，均應擇一從重處罰。倘營利事業因一時不察取得非實際交易對象開立之統一發票，作為進項憑證申報扣抵銷項稅額，經稽徵機關查獲後，可提示所保存之交易資料及支付價款證明，供國稅局查明並對實際銷貨之營利事業補稅處罰，以符合營業稅法第51條第2項及稅捐稽徵法第44條第1項但書免予處罰之規定。

該局舉例，轄內甲公司106年11月間申報乙公司開立之統一發票銷售額1,000,000元，營業稅額50,000元，作為進項憑證申報扣抵銷項稅額，嗣該局查獲乙公司開立之統一發票為不實進項憑證，核定補徵甲公司營業稅額50,000元，並處罰鍰50,000元。甲公司不服該罰鍰處分申請復查，主張所取得乙公司開立之統一發票係A君交付，並提供交易時留存之金流文件及聯絡資訊。嗣經該局查明A君係實際交易人，且甲公司所取得乙公司開立之統一發票確由A君直接交付予甲公司，該局遂就A君涉及未辦理稅籍登記銷售貨物一案依法補稅處罰在案，並經復查決定將甲公司之罰鍰予以註銷。